تعد تكاليف النقل الجوي أغلى من تكاليف النقل بالوسائل الأخرى للأسباب الاتية :
1. انخفاض الطاقة التحميلية للطائرات مقارنة بوسائل النقل الأخرى
2. تأثير الظروف المناخية يساهم في تأخر اقلاع و هبوط الطائرات
3. لا يوفر عملية النقل من الباب الى الباب مما يزيد في عملية الشحن و التفريغ
4. ارتفاع تكاليف الصيانة و التأمين
5. التكالييف الباهظة لتشييد المطارات
6.ارتفاع استهلاك الوقود باهظ الثمن
7.حوادث الطائرات مكلفة كما أن فرص النجاة فيها مكلفة