أضرار الأمطار الحمضية هي:
1- الأمطار الحمضية تحتوي على كثير من الأحماض، بالتالي تزيد من صعوبة امتصاص الأسماك للأكسجين والمعادن التي توجد في المياه مما يؤدي إلى موتها في الغالب.
2- عندما تتشرب التربة المطر الحمضي فإنها تجعل التربة تحتوي على معادن سامة، وبالتالي تمنع من تكاثر النباتات، أو ربما تؤدي إلى موت النباتات وهي من الأغذية الرئيسية للإنسان.
3- النباتات أو الحيوانات التي تسممت عن طريق الأمطار الحمضية تسبب في أضرار بالغة لخلايا مخ الإنسان وخاصة الأطفال، مما ينتج عنه أمراض غاية في الخطورة أو ربما تسببت في الوفاة.
4- تحتوي الأمطار الحمضية على غاز ثاني أوكسيد الكبريت غاز أكسيد النيتروجين مما يتسبب في أضرار بالغة للجهاز التنفسي خاصة لمرضى الربو.