يمتاز المجهر الضوئى المركب عن المجهر الالكترونى الماسح
بان تكلفتة منخفضة مقارتة بالمجهر الالكترونى
يمتاز بالبساطة وان استعمالة اسهل من المجهر الالكترونى
الوان المجهر الضوئى يعرض الصور بالوان بسيطة وطبيعية بعكس المجهر الالكترونى الذى يعرض الصور باللون الرمادى
يستخدم المجهر الضوئى عدسات بسيطة عكس المجهر الالكترونى الذى يستعمل عدسات كهربائية او كهرومغناطيسية